양봉 아시아 꿀벌 유충을 감염시키는 Ascosphaera apis에서 miRNAlike RNA의 글로벌 발견, 발현 패턴 및 규제 …
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아시아 꿀벌 유충을 감염시키는 Ascosphaera apis에서 miRNAlike RNA의 글로벌 발견, 발현 패턴 및 규제 역할
특수한 곰팡이 병원균인 Ascosphaera apis는 꿀벌 유충에 치명적인 감염을 일으킵니다. miRNA 유사 소형 RNA(milRNA)는 miRNA와 유사한 곰팡이 소형 비코딩 RNA로, 곰팡이 균사 성장, 포자 형성 및 병원성을 조절하는 것으로 나타났습니다. 전사체 데이터를 기반으로, Apis cerana cerana 일꾼 4, 5, 6일 된 유충(Aa-4, Aa-5 및 Aa-6)을 감염시키는 A. apis에서 차별적으로 발현되는 miRNA 유사 RNA(DEmilRNA)를 선별하여 추세 분석을 거친 후, 타겟 예측 및 주석을 달고 조절 네트워크를 조사했습니다. 특히 MAPK 신호 전달 경로, 글리세로지질 대사, 슈퍼옥사이드 디스뮤타아제, 키틴 합성 및 분해와 관련된 효소와 관련된 하위 네트워크에 초점을 맞추었습니다. 18nt에서 25nt까지의 길이 분포를 가진 총 606개의 milRNA가 식별되었습니다. 이러한 milRNA의 첫 번째 뉴클레오티드는 U에 대한 편향을 나타냈으며, milRNA의 염기에 걸친 편향 패턴은 앞서 언급한 세 그룹에서 유사했습니다. 253개의 milRNA가 있었고, 그 중 68개의 상향 조절된 milRNA와 54개의 하향 조절된 milRNA가 이 그룹에서 공유되었습니다. 또한, 3개의 milRNA의 발현과 서열은 스템-루프 RT-PCR과 샌거 시퀀싱으로 검증되었습니다. 추세 분석에 따르면 79개의 DEmilRNA가 세 가지 중요한 프로필(Profile4, Profile6, Profile7)로 분류되었습니다. 이 세 가지 중요한 프로필에서 DEmilRNA의 표적 mRNA는 국소화, 항산화 활성, 핵소체와 같은 42개의 GO 용어에 관여했습니다. 이러한 표적은 또한 라이신 생합성, 피루브산 대사, 항생제 생합성을 포함한 120개의 KEGG 경로에도 관여했습니다. 추가 조사에 따르면 DEmilRNA 표적 mRNA는 MAPK 신호 전달 경로, 글리세로지질 대사, 슈퍼옥사이드 디스뮤타아제, 키틴 합성 및 분해와 관련된 효소와 관련이 있는 것으로 나타났습니다. 또한 aap-milR10516-x와 ChsD 사이, 그리고 aap-milR-2478-y와 mkh1 사이의 결합 관계는 이중 루시퍼라제 리포터 유전자 검정과 RT-qPCR을 조합하여 확인했습니다. 저희의 데이터는 A. apis의 증식과 침입에 대한 새로운 통찰력을 제공할 뿐만 아니라 A. apis 감염의 근저에 있는 DEmilRNA 조절 메커니즘을 설명하는 기초를 마련합니다.
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